相對一般的污水排放井而言，化糞池極易產生沼氣。一般在排污管道里，由于有水在流動，就算產生了沼氣，也會隨著水流及井蓋上的小孔向外排出。而化糞池不同，它是利用沉淀和厭氧發酵原理，去除生活污水中的懸浮性有機物，厭氧反應會產生大量的沼氣。
我國目前有磚砌化糞池、鋼筋砼化糞池、玻璃鋼化糞池、不銹鋼化糞池等種類。由于城區內的化糞池建設使用的基本上都是定型產品，因此在日常工作中，工作人員一般只負責按照標準選用化糞池的材質，以及規劃安放的位置。一般會把化糞池安放在位置較偏、一般人不會去玩耍的地方，如綠化帶、道路的邊緣區域。
盡管井蓋上一般有兩個小孔，可以排氣，但一般都較小，且如果設置在路中央，極易堵塞。沼氣含有大量甲烷，一旦遇到微火源或摩擦，便會發生爆炸。其沖力之大，目前任何材質的井蓋都阻擋不住。
為防止生物化糞池發生爆炸，首先，小區的居民不應隨意將渣滓往化糞池傾倒，并保持定期清掏;另外，不要在污水井、化糞池和下水道口放鞭炮，遠離火源;同時，每個化糞池應設專門的通氣管，并保證其通暢。
